形成時間：1937年-1947年

數   量：183卷

保管單位：南京市檔案館

內容及評介：1937年12月13日至1945年8月15日，日軍占領南京。日軍入侵南京檔案詳細記載日軍在南京制造大屠殺的罪惡事實，以及在侵占南京期間犯下的其它大量罪行。主要內容有：被害人姓名、被害時間和地點；戰時慈善團體救濟難民、掩埋尸體情況統計；戰后南京市政府及所屬機構和區公所對南京市民遭受日軍屠殺和財產損失的調查，南京市臨時參議會關于南京大屠殺的調查報告和南京市民遭受燒殺淫掠的申訴材料等。該檔案絕大部分為原件，是揭露日軍侵華罪行，研究中國抗戰，進行愛國主義教育的珍貴史料。

世界紅十字會南京分會救濟隊掩埋組掩埋尸體具數統計表

南京市崇善堂掩埋隊工作一覽表

中國紅十字會南京分會關于救濟難民一事請求南京難民區國際委員會給予援助的報告

南京市臨時參議會關于南京大屠殺案的調查報告（陸李秀英口述證詞）

魯甦陳述日軍在草鞋峽集體屠殺的結文

徐洪氏為家中四口遭日軍殘害致何應欽呈文

戰犯谷壽夫判決書

來源：江蘇省檔案局 江蘇省檔案館 《江蘇珍貴檔案圖鑒》